ciência
trabalho com machine learning interpretável para dados biológicos: modelos cujas decisões podem ser lidas, conferidas e contestadas. minha pesquisa de mestrado na utfpr (ppgtca) é sobre o microbioma da soja.
o modelo aprende a doença, ou o estudo?
uma meta-análise de microbioma cervicovaginal em câncer cervical, reprocessada a partir das leituras brutas de 16s: 10 projetos públicos, 889 amostras após o controle de qualidade. com validação cruzada aleatória o classificador chega a macro-auc de 0,81. deixando um projeto inteiro de fora por vez, cai para 0,60. o projeto de origem explica cerca de 16 vezes mais variação do que a condição clínica.
- método
- qiime 2, permanova, gllvm, random forest, leave-one-project-out
- publicado
- latin.science 2026 (latinoware)
microbioma do solo sob estresse hídrico
uma réplica completa de hagen et al. (2024), refeita a partir dos dados brutos: 623 amostras de sequenciamento 16s, cinco métodos de abundância diferencial e um random forest explicado com shap em cinco níveis taxonômicos. o nível de gênero foi o melhor, com auc de 0,979, próximo do artigo original, e o shap apontou os mesmos táxons marcadores.
- método
- qiime 2, dada2, phyloseq, random forest, shap
- publicado
- sbproppg 2026 (utfpr)
do microbioma a um mapa de prescrição
um classificador lê o estresse hídrico nas bactérias do solo, o shap aponta os táxons marcadores, e a saída vira um mapa de prescrição: uma dose de bioinsumo para cada zona do talhão. num talhão sintético de 25 ha, a aplicação em taxa variável usou cerca de 52% menos insumo do que a uniforme. feito com dados simulados, para validar o pipeline de ponta a ponta.
- método
- python, random forest, shap, nested cross-validation
visão computacional na embrapa
de 2020 a 2021, na iniciação científica: detecção de frutas em pomares com yolo e opencv, e contagem automática de maçãs que economizou 100+ horas de trabalho manual por safra.
artigos publicados
- 2026validação por projeto em meta-análises de microbioma: um estudo de caso em câncer cervical · latin.science (latinoware)
- 2026validação multiprojeto em análise de dados físico-químicos do solo · latin.science (latinoware)
- 2026aprendizado de máquina interpretável e microbioma do solo: replicação de pipeline para detecção de estresse hídrico · sbproppg (utfpr)
- 2021prêmio de melhor artigo curto · xvii latinoware
- 2020–21dois artigos em visão computacional aplicada à fruticultura · embrapa